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1、確定品種、目的和產能。首先，在進行組培室設計圖的設計時，就應該考慮想要生產的品種，這點大家往往并不是很重視。很多人以為建設一個組培室，將來是可以生產很多甚至是所有的任何植物品種，這是常見的誤區。其實不同植物的品種其組培特性也是不同的，培養周期是不同的，培養條件也是不同的。不根據品種特性而盲目的設計，會對將來的空間利用、生產效率、環境控制以及生產成本等造成難以估量的影響。其次還要考慮生產的目的，是快速擴繁?還是種苗脫毒?是銷售瓶苗、半成苗還是銷售成苗?這些都需要在設計階段充分考慮，并在進行組培室設計圖時充分標明清楚。不同的目的對于組培室的布局設計也是不同的。再者就是產能，結合品種、市場、自身條件設定目標產能，根據產能以確定組培室的規模。

2、合理空間布局，提高工作效率。一個好的空間布局至少應該滿足以下幾個基本的條件：

一是有完備的功能間，可以進行流水化作業;

二是能夠區分人及物流通道，避免交叉。

三是有潔凈控制區與非控制區之分，區域之間有相應的過度措施。

3、根據規模，合理選材，降低建設成本。凈化材料、鋁合金+玻璃、環氧地坪、PVC地板、潔凈燈具等用于組培室的裝修材料有很多。我們應該根據組培室面積、資金預算、預設產能等綜合考慮選擇何種材料進行主體的裝修。找到好的組合，實現較好的投入產出比。

4、區域潔凈處理，降低培養過程中的污染率。組培過程中的污染是任何組培室都不能回避的問題。因此無論規模大小與否，都應該建立相應的潔凈控制區。當然不同的規模、不同的投資可以選擇不同的方式(管道式通風凈化處理、移動式自行凈化處理、FFU式區域凈化處理、新風換氣式凈化處理等。

5、合理的暖通設計，降低運營成本。根據組培室設計圖的設計規模配備相應的暖通布局，暖通設計。其實主要考慮的空調制冷和溫度的均勻度，是培養室重點。規模大的、能夠快速進入規模化生產的可以考慮集中式中央空調設計。但是對于小規模、且目標不明確或者說不能快速進入生產狀態的組培室通常建議使用分體式空調設計，這樣在前期的生產過程中，運營成本會降低很多。

6、重視消防設計，杜絕火災等安全隱患。任何形式的組培室在這點上面都是在設計階段必須要考慮的。裝修材料、線路設計、應急通道、安全門等事關安全的因素必須都要考慮在內。